MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 1864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013370	CAAT	2	8	187	194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013370	GCT	2	6	219	224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871127
4	NC_013370	CTTGAG	2	12	240	251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260871127
5	NC_013370	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	260871127
6	NC_013370	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871127
7	NC_013370	AAT	2	6	419	424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871127
8	NC_013370	TGA	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013370	ACG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871128
10	NC_013370	CAAAA	2	10	497	506	80 %	0 %	0 %	20 %	260871128
11	NC_013370	GCT	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871128
12	NC_013370	AATGAA	2	12	526	537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260871128
13	NC_013370	AGA	2	6	570	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871128
14	NC_013370	GATA	2	8	636	643	50 %	25 %	25 %	0 %	260871128
15	NC_013370	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	260871128
16	NC_013370	A	7	7	677	683	100 %	0 %	0 %	0 %	260871128
17	NC_013370	AGC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871128
18	NC_013370	GAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871128
19	NC_013370	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871128
20	NC_013370	ATA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871128
21	NC_013370	TGA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871129
22	NC_013370	GGC	2	6	995	1000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871129
23	NC_013370	TCG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871129
24	NC_013370	GAAAA	2	10	1201	1210	80 %	0 %	20 %	0 %	260871129
25	NC_013370	GTTC	2	8	1272	1279	0 %	50 %	25 %	25 %	260871129
26	NC_013370	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871129
27	NC_013370	A	6	6	1568	1573	100 %	0 %	0 %	0 %	260871129
28	NC_013370	CAT	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871129
29	NC_013370	CCA	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871129
30	NC_013370	GATT	2	8	1648	1655	25 %	50 %	25 %	0 %	260871129
31	NC_013370	CCTGG	2	10	1688	1697	0 %	20 %	40 %	40 %	260871129
32	NC_013370	CG	3	6	1724	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	260871129
33	NC_013370	TGG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871129
34	NC_013370	CTG	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871129
35	NC_013370	ATT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013370	CTGT	2	8	1961	1968	0 %	50 %	25 %	25 %	260871130
37	NC_013370	TGA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871130
38	NC_013370	GGA	3	9	2104	2112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871130
39	NC_013370	GCGCG	2	10	2114	2123	0 %	0 %	60 %	40 %	260871130
40	NC_013370	GGTAA	2	10	2162	2171	40 %	20 %	40 %	0 %	260871130
41	NC_013370	ATG	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871130
42	NC_013370	A	7	7	2232	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	260871130
43	NC_013370	CAAT	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013370	AAG	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013370	CA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013370	ATGAA	2	10	2344	2353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013370	TCT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013370	CAT	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013370	GGC	2	6	2446	2451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013370	GCC	2	6	2458	2463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013370	T	6	6	2464	2469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013370	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871131
53	NC_013370	AGC	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871131
54	NC_013370	TCA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
55	NC_013370	CTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871131
56	NC_013370	CAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
57	NC_013370	CCA	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871131
58	NC_013370	GCT	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871131
59	NC_013370	TGG	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871131
60	NC_013370	CAGC	2	8	2855	2862	25 %	0 %	25 %	50 %	260871131
61	NC_013370	CTC	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871131
62	NC_013370	GA	3	6	3027	3032	50 %	0 %	50 %	0 %	260871131
63	NC_013370	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	260871131
64	NC_013370	AGT	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
65	NC_013370	CAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
66	NC_013370	ATG	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
67	NC_013370	TCA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
68	NC_013370	AAC	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
69	NC_013370	CTGAA	2	10	3288	3297	40 %	20 %	20 %	20 %	260871131
70	NC_013370	TG	3	6	3341	3346	0 %	50 %	50 %	0 %	260871131
71	NC_013370	CCT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871131
72	NC_013370	CAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871131
73	NC_013370	GTT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871131
74	NC_013370	AGT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
75	NC_013370	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
76	NC_013370	CCT	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871132
77	NC_013370	GA	3	6	3632	3637	50 %	0 %	50 %	0 %	260871132
78	NC_013370	GAGC	2	8	3696	3703	25 %	0 %	50 %	25 %	260871132
79	NC_013370	TCT	2	6	3708	3713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871132
80	NC_013370	AAC	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013370	CAG	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871133
82	NC_013370	CCA	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871133
83	NC_013370	ACG	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013370	ACG	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013370	GTA	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013370	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013370	AT	3	6	4213	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013370	TCAG	2	8	4258	4265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013370	ATC	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013370	GGAT	2	8	4286	4293	25 %	25 %	50 %	0 %	260871134
91	NC_013370	GCC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871134
92	NC_013370	TGG	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871134
93	NC_013370	CTTTT	2	10	4375	4384	0 %	80 %	0 %	20 %	260871134
94	NC_013370	T	6	6	4381	4386	0 %	100 %	0 %	0 %	260871134
95	NC_013370	GTT	2	6	4417	4422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871134
96	NC_013370	CTG	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871134
97	NC_013370	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871134
98	NC_013370	CGC	3	9	4510	4518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871134
99	NC_013370	GCT	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871134
100	NC_013370	TGG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871134
101	NC_013370	TTA	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871134
102	NC_013370	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871134
103	NC_013370	A	6	6	4783	4788	100 %	0 %	0 %	0 %	260871134
104	NC_013370	ACA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871134
105	NC_013370	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871135
106	NC_013370	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871135
107	NC_013370	CGA	2	6	5181	5186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871135
108	NC_013370	GTA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871135
109	NC_013370	TC	3	6	5333	5338	0 %	50 %	0 %	50 %	260871136
110	NC_013370	GTC	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871136
111	NC_013370	CTT	2	6	5402	5407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871136
112	NC_013370	GAC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871136
113	NC_013370	TAA	2	6	5574	5579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871136
114	NC_013370	T	6	6	5580	5585	0 %	100 %	0 %	0 %	260871136
115	NC_013370	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871136
116	NC_013370	TCT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871136
117	NC_013370	AAC	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871136
118	NC_013370	TTG	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871137
119	NC_013370	CCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
120	NC_013370	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871137
121	NC_013370	CAGC	2	8	5901	5908	25 %	0 %	25 %	50 %	260871137
122	NC_013370	GCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
123	NC_013370	CAT	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
124	NC_013370	CGG	2	6	6032	6037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
125	NC_013370	TGG	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871137
126	NC_013370	TGA	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
127	NC_013370	CTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871137
128	NC_013370	GGC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
129	NC_013370	TCC	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871137
130	NC_013370	CCA	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
131	NC_013370	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
132	NC_013370	TGG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871137
133	NC_013370	GCG	2	6	6508	6513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
134	NC_013370	CTG	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
135	NC_013370	CG	3	6	6553	6558	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
136	NC_013370	TGC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
137	NC_013370	CTGTG	2	10	6621	6630	0 %	40 %	40 %	20 %	260871137
138	NC_013370	TCAG	2	8	6838	6845	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
139	NC_013370	CAT	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
140	NC_013370	GAC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
141	NC_013370	GC	3	6	6926	6931	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
142	NC_013370	CAA	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871137
143	NC_013370	GCT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
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146	NC_013370	GC	3	6	7240	7245	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
147	NC_013370	GTA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
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149	NC_013370	ACTC	2	8	7340	7347	25 %	25 %	0 %	50 %	260871137
150	NC_013370	TTTA	2	8	7386	7393	25 %	75 %	0 %	0 %	260871137
151	NC_013370	TCC	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871137
152	NC_013370	AAT	2	6	7456	7461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871137
153	NC_013370	GA	3	6	7484	7489	50 %	0 %	50 %	0 %	260871137
154	NC_013370	ACG	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
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156	NC_013370	AAC	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871137
157	NC_013370	TG	3	6	7554	7559	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
158	NC_013370	GCT	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
159	NC_013370	CGG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
160	NC_013370	TTC	2	6	7667	7672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871137
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164	NC_013370	CAT	2	6	7809	7814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
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167	NC_013370	AGT	3	9	7982	7990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
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169	NC_013370	CTGG	2	8	8053	8060	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
170	NC_013370	GAT	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
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174	NC_013370	GCCC	2	8	8189	8196	0 %	0 %	25 %	75 %	260871137
175	NC_013370	CATTT	2	10	8202	8211	20 %	60 %	0 %	20 %	260871137
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177	NC_013370	CGG	2	6	8298	8303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
178	NC_013370	TGC	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
179	NC_013370	T	6	6	8432	8437	0 %	100 %	0 %	0 %	260871137
180	NC_013370	GAT	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
181	NC_013370	TATC	2	8	8618	8625	25 %	50 %	0 %	25 %	260871137
182	NC_013370	TGC	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
183	NC_013370	ATC	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
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192	NC_013370	CGC	2	6	8922	8927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871137
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195	NC_013370	CTG	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
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204	NC_013370	GCCCGC	2	12	9266	9277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871137
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214	NC_013370	GAC	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
215	NC_013370	CGA	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
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218	NC_013370	ACTG	2	8	10465	10472	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
219	NC_013370	CTG	2	6	10568	10573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
220	NC_013370	GTT	2	6	10620	10625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871137
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226	NC_013370	TGGAT	2	10	10831	10840	20 %	40 %	40 %	0 %	260871137
227	NC_013370	TGG	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871137
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230	NC_013370	CTGC	2	8	11057	11064	0 %	25 %	25 %	50 %	260871137
231	NC_013370	GCT	2	6	11087	11092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
232	NC_013370	CGG	2	6	11117	11122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
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235	NC_013370	CCA	2	6	11216	11221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
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239	NC_013370	TGT	2	6	11307	11312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871137
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243	NC_013370	CAA	2	6	11459	11464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871137
244	NC_013370	CGGT	2	8	11471	11478	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
245	NC_013370	CGG	2	6	11629	11634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
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248	NC_013370	CGG	2	6	11889	11894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
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250	NC_013370	GT	3	6	11999	12004	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
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252	NC_013370	GAAT	2	8	12045	12052	50 %	25 %	25 %	0 %	260871137
253	NC_013370	AAC	2	6	12115	12120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871137
254	NC_013370	CTG	2	6	12142	12147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
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256	NC_013370	CCG	2	6	12206	12211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871137
257	NC_013370	GT	3	6	12287	12292	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
258	NC_013370	GCC	2	6	12318	12323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871137
259	NC_013370	CCAG	2	8	12337	12344	25 %	0 %	25 %	50 %	260871137
260	NC_013370	CCA	2	6	12380	12385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
261	NC_013370	ATAG	2	8	12550	12557	50 %	25 %	25 %	0 %	260871137
262	NC_013370	ATT	2	6	12619	12624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013370	ACA	2	6	12718	12723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871138
264	NC_013370	TCC	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871138
265	NC_013370	GCTG	2	8	12737	12744	0 %	25 %	50 %	25 %	260871138
266	NC_013370	CGG	2	6	12749	12754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871138
267	NC_013370	CTT	2	6	12803	12808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871138
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270	NC_013370	TGG	2	6	12850	12855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871138
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273	NC_013370	CT	3	6	12984	12989	0 %	50 %	0 %	50 %	260871138
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277	NC_013370	TGA	2	6	13084	13089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871138
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288	NC_013370	AGC	2	6	13640	13645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871138
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381	NC_013370	ATT	2	6	17971	17976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_013370	TCT	2	6	17979	17984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_013370	AGCTA	2	10	18177	18186	40 %	20 %	20 %	20 %	260871145
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390	NC_013370	TTA	2	6	18506	18511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_013370	GTC	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_013370	GATG	2	8	18553	18560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_013370	TCA	2	6	18619	18624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871146
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